La nuova stagione prende il via in uno scenario completamente diverso dal passato: l'Unità Intelligence è stata sciolta e Voight è tornato al servizio di pattuglia. L'escalation della criminalità, però, lo convince che Chicago abbia ancora bisogno della sua squadra. Nel corso di un'indagine entra in contatto con Eva Imani, agente sotto copertura dell'ATF, il cui aiuto potrebbe rivelarsi decisivo per riportare in attività l'unità speciale. Nel frattempo, Kim Burgess e Dante Torres cercano di ricostruire la propria carriera dopo aver perso il distintivo, confrontandosi con una realtà molto diversa da quella vissuta fino a quel momento.
Una volta ricostituita, l'Unità Intelligence viene subito chiamata ad affrontare un caso particolarmente delicato: la misteriosa scomparsa di un uomo residente nel quartiere di Torres. Le indagini si trasformano in una corsa contro il tempo per ritrovare il rapito, mentre il caso coinvolge profondamente lo stesso Torres, spingendolo a riflettere sul proprio passato, sulla fede e sulle scelte che hanno segnato la sua vita.
Tra nuove sfide, indagini ad alta tensione e rapporti da ricostruire, la tredicesima stagione promette di rilanciare uno dei crime più apprezzati dal pubblico televisivo.
